高雄港所在地于明朝后期是一个小渔村，荷兰入侵与郑成功来台时期都有开拓，清初已成为高屏地区商品集散中枢，1858年中英天津条约高雄港开口通商，1863年成立高雄海关；日据时代日人发现高雄港港湾水浅，港口有礁岩，港外有浅滩，便有筑港之议，高筑港计画的关键人物是台湾总督府土木局技师川上浩二郎，于1900年后展开多次计画拓建，至1939年达到高雄港吞吐量的最高峰；至1945年10月正式成立“高雄港务局”主管港务，打捞战后沉船以及清理航道，1955年始恢复正常营运；1959年后高雄港展开12年扩建计画等多项措施，至2000年高雄港再度建成5个货柜中心，8个新建深水码头，成为今日我们所见到的高雄港。 N,ZmGzNP)
高雄港曾长期位居世界海洋货运第三大港，仅次于香港与新加坡，目前高雄港货运进出量约占全台66%。据台湾“今日新闻”报道，2008年全球前20大货柜港排名出炉，高雄港从第8名下滑到第12名，吞吐量减少了5.7%。随着两岸是同的实现，高雄港加强与大陆港口的海运交流。据台“中国时报”报道，两岸港口合作首传喜讯，大连港与高雄港定于14日缔结为姐妹港，这是两岸实现海运直航以来，第一件重要港口的缔盟。未来双方将加强合作开辟航线，扩大人才交流及物流。由于大连港是大陆东北最重要的原料输出港口，两港口合作有助于台湾南部产业的发展。 N,ZmGzNP)
1895年根据马关条约台湾割让日本，台湾民主国成立并发起战事抵抗，日军于1896年9月方占领港区。日本为强化本港货运功能，于1900年后展开多次计划拓建，1912年初步建成七座码头，可泊3,000吨船只。1937年完成二度改建，可停8,000吨船只，码头扩至16座，仓库19座。10,000吨船只也可进出港区。航线方面，1924年已有高雄-横滨线、高雄-广东线、高雄-天津线、台湾-朝鲜满州国线等，贸易总额当年吞吐量达158万吨。1939年吞吐量又巨升至320万吨，达到日据高雄的最高峰。 N,ZmGzNP)
1944年中期以后，盟军在太平洋战场展开反攻，美军已渐次赢得新几内亚、赛班岛、菲律宾等战场胜利，空军已能对台湾、琉球直接空袭。10月以后，高雄港遭到盟军猛烈轰炸，所有码头仓库几尽摧毁。日军为避免美军占领后利用本港补给海军，自沉大船五艘封锁港道，高雄港几乎成为死港。 N,ZmGzNP)
中华民国时期 N,ZmGzNP)
1945年日本战败，国民政府来台接收后，于10月正式成立“高雄港务局”主管本港业务，打捞沉船以清理航道，至1955年始恢复本港正常营运。1959年后本港展开十二年扩建计划等多项措施，至1980年高雄港已有深水码头27座，浅水码头2座。附设高雄加工出口区、前镇渔港、临海工业区、一贯作业大炼钢厂、中国造船厂，以及第一、二、三、四货柜中心等。至2000年，本港再度建成5个货柜中心，8个新建深水码头，营运货柜能力达到1,000万标准箱(TUE)。
